要調(diào)干凈的水，要保證一路上水不能臟。這是南水北調(diào)的基本原則。然而，根據(jù)水利部長(zhǎng)江水利委員會(huì)水保局丹江口分局提供的信息，目前進(jìn)入庫區(qū)的神定河、泗河、犟河、老灌河等河流污染嚴(yán)重，為五類或劣五類水。報(bào)道稱，明年通水在即，南水北調(diào)中線水源地的水質(zhì)、水量、水權(quán)“三憂”仍待解。
據(jù)中國(guó)經(jīng)濟(jì)周刊報(bào)道，國(guó)家先后批復(fù)了丹江口庫區(qū)及上游水源區(qū)污染治理和水土保持、經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展的“十一五”和“十二五”規(guī)劃，專門劃定了一級(jí)和二級(jí)水源保護(hù)區(qū)。根據(jù)規(guī)劃，在2014年中線通水前，丹江口水庫的水質(zhì)要達(dá)到二類，2015年末直接匯入水庫的主要支流，其水質(zhì)不能低于三類。
然而，根據(jù)水利部長(zhǎng)江水利委員會(huì)水保局丹江口分局提供的信息，目前進(jìn)入庫區(qū)的神定河、泗河、犟河、老灌河等河流污染嚴(yán)重，為五類或劣五類水。9月13日，中國(guó)經(jīng)濟(jì)周刊記者在十堰市污水處理廠的神定河出水口處看到，處理完的水排到河中和河內(nèi)的水形成兩種不同的色澤，排出的水清亮，而河道里從上游流來的水是黑水。另外，淅川縣城區(qū)每年40%的生活污水直接排入老灌河。由于老灌河污染嚴(yán)重，河水富營(yíng)養(yǎng)化程度很高，遠(yuǎn)遠(yuǎn)就能看到河面上生長(zhǎng)出了許多紅色藻類植物。
另外，近年來，由于丹江口水庫上游雨量減少及用水量增加等因素，庫區(qū)來水量低于多年平均來水量，有可能導(dǎo)致南水北調(diào)的供水量不確定。據(jù)權(quán)威預(yù)測(cè)，嚴(yán)重枯水期可能就無水可調(diào)。
此外，陶岔渠首水源管理權(quán)至今仍是懸念，地方政府、中線水源公司、漢江集團(tuán)等之間的爭(zhēng)奪還在繼續(xù)。而更高層面，水利部、國(guó)務(wù)院南水北調(diào)工程建設(shè)委員會(huì)辦公室之間的博弈依然沒有定案。
根據(jù)淅川縣環(huán)保局提供的數(shù)據(jù)，2012年1—12月對(duì)淅川縣九重鎮(zhèn)陶岔村渠首斷面的水質(zhì)監(jiān)測(cè)，總氮全部超標(biāo)，大部分超出國(guó)家制定的地表水四類水總氮1.5mg/L的標(biāo)準(zhǔn)，有的月份甚至接近五類水的標(biāo)準(zhǔn)，最高的是9月份，達(dá)到每升1.9毫克，最低的6月份也達(dá)到了1.19毫克。這些數(shù)值都超出了國(guó)家要求的丹江口水庫達(dá)到二類水總氮0.5mg/L的標(biāo)準(zhǔn)。而對(duì)丹江的監(jiān)測(cè)結(jié)果更為嚴(yán)重，在淅川史家灣的取樣監(jiān)測(cè)中，總氮的含量已經(jīng)是劣五類的標(biāo)準(zhǔn)，最高的達(dá)到了4.5mg/L，最低的也是2.03mg/L，都超過國(guó)家地表水五類水2mg/L的標(biāo)準(zhǔn)。丹江口市環(huán)保局提供的庫區(qū)水質(zhì)監(jiān)測(cè)報(bào)告，總氮也是全部超標(biāo)。
值得一提的是，淅川縣和丹江口市環(huán)保局提供的監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)，只是按照環(huán)保部和國(guó)家質(zhì)檢總局2002年頒布的地表水環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)中的29個(gè)項(xiàng)目進(jìn)行監(jiān)測(cè)的，而同時(shí)頒布的共有109項(xiàng)，環(huán)保部曾要求飲用水源地按照109項(xiàng)標(biāo)準(zhǔn)執(zhí)行，但由于受監(jiān)測(cè)條件所限，地方環(huán)保部門只能監(jiān)測(cè)29項(xiàng)。
丹江口市環(huán)保局總工程師陳進(jìn)春說，目前，在湖北省能夠監(jiān)測(cè)109項(xiàng)標(biāo)準(zhǔn)的，只有武漢、宜昌、襄陽三個(gè)城市，其他地方環(huán)保部門無法達(dá)到。丹江口水庫的水質(zhì)，還有像甲醛、乙醛、樂果、敵敵畏、敵百蟲等80項(xiàng)有機(jī)物的含量是否超標(biāo)，外界根本無法知曉。