中國的水產品產量居世界首位，是世界上惟一的水產養殖產量超過捕撈產量的國家。環保部今天公開征求意見的水產養殖污染防治技術政策編制說明（以下簡稱說明）透露，在水產業快速發展的同時也留下嚴重的污染隱患，說明表示，七大水系中50%河段不符合漁業水質標準。
根據中國環科院的調研，近年來，我國在全球動物性食品生產中增長最快。中國環科院稱，在20 世紀90 年代初期我國水產養殖總量超過世界其他國家的總和；進行規模化養殖的水產品種類已達50 多種；2010 年，全國水產養殖面積764.5 萬公頃。
中國環科院認為，隨著我國水產養殖業的快速發展，水產養殖過程中含有殘餌、殘骸、排泄物、化學藥劑的廢水大量排入水體造成污染，此外，水產養殖業總體規劃無序，放養密度不合理，排泄物超過環境的承受力，水域生態平衡也受到嚴重破壞。
“目前，我國水環境污染嚴重，72，72%的河段被污染，并主要為有機污染。全國532 條河中，有438 條污染，占82.3%，其中，局部養殖水域污染十分嚴重，水生態系統與漁業資源嚴重破壞，導致魚蝦死亡率增加，或種類與種群數量下降。”中國環科院表示，導致生態惡化、破壞，加劇漁業資源衰退的原因主要是不合理的填河圍湖、不當攔河筑壩、圍海造田、以犧牲環境為代價的盲目養殖、傳統養殖。同時，近二十年來中國大量的池塘集約化養殖，投入了上千萬噸的餌、肥料和大量藥物，這也導致了每年近3 億立方米養殖廢水的排放，更加劇了江河湖庫的富營養化和污染程度。
中國環科院引用2011 年全國漁業生態環境監測網的監測數據說，我國的漁業資源持續衰退，不適用于漁業水域的海域中，渤海占79%，黃海占45%，東海占78%，南海占28%。同時，七大水系中50%河段不符合漁業水質標準，其中，淮河、海河、松花江與遼河系污染嚴重。其占淡水魚類捕撈量90%，超漁業水質指標水域占26%（5000km）。
說明表示，目前，我國在水產養殖業方面也頒布了一些法律法規，如《漁業法》、《海洋環境保護法》等，但這些法律也面臨著部分條款法律強制力不夠；法規體系不完善，執法依據不足；一些法律規范之間出現沖突，缺乏專項法律等問題。說明稱，環保部將通過頒布水產養殖污染防治技術政策等來遏制養殖業的污染問題，目前，該技術政策正在公開征求意見。