行政有區劃，生態無邊界。在第二屆青年治淮論壇上，來自淮河流域四?。ㄍ?、蘇、魯、豫）的水利專家針對目前流域斷面水質逐漸改善，污染卻仍然嚴重的現狀紛紛建言獻策，指出淮河流域生態補償機制亟待建立。
南京水利科學研究院院長、中國工程院院士張建云說，應加快建立健全資源有償使用制度和生態補償制度，形成導向明確、公平合理的激勵機制，調整經濟發展和生態建設相關各方利益關系，才能提高生態建設和保護工作的積極性。
“要建立生態補償財政轉移支付制度，對生態紅線內的重要自然保護區，重要濕地，重要水源地和公益林地等，因實施生態保護而形成的貢獻給予生態補償。”張建云說。
淮河流域水資源既相對豐富，又難以滿足區域內經濟增長需求，從絕對概念上講，是一個嚴重缺水區。中國東部沿海的山東省是最嚴格水資源管理制度的先行先試省份，2011年出臺了全國第一個用水總量控制管理辦法，對水資源嚴格實行紅線管理。
山東省水利廳副廳長馬承新表示，淮河作為嚴重缺水區卻存在資源利用率不高的問題，“一個區域缺水，另一個區域棄水，豐缺不能互補，河湖聯通，建設水網，勢在必行；多用水不受懲罰，少用水得不到鼓勵，生態補償機制亟待建立。”
目前中國基于水污染控制的流域跨區補償模式很大程度上是水環境問題倒逼機制作用的結果，它以設定責任斷面和水質目標為前提，通過考核使政府進行強制性經濟處罰或獎勵，取得了一定效果，但也存在懲罰依據不充分、資金來源單一、實踐范圍較小的不足。
張建云說，要“引入市場機制，對產權關系相對明確的生態補償類型進行補償，主要包括自組織交易，配額交易，生態標簽，排放許可證交易，碳匯交易等模式。”